常用抗体信息数据库总结

· Antibodypedia

Antibodypedia 是一个包含供应商信息（例如，产品编号、供应商名称、宿主物种、克隆性、纯化过程、反应性、同种型、浓度、储存、验证数据）、参考文献、用户提交的验证数据和用户评论的抗体数据库。除以上信息之外，Antibodypedia 还提供一些其他资源，例如Nature Protocols 的实验方案的链接、常见蛋白质家族列表、以及其他蛋白质相关资源的链接。除此之外，Antibodypedia还为上传验证数据的提供资金奖励，以及报告错误的选项。

· Antibody Resource

Antibody Resource 是一个以表格形式输出抗体试剂信息的数据库，其信息包括供应商名称、供应商的产品编号、宿主物种、克隆性、物种反应性（是否可以跨不同物种检测蛋白质）和相关应用（例如是否适用于蛋白质印迹等）。此外，Antibody Resource 还提供抗体的生物学通路等信息，和分享其他媒体途径（如播客）的知识资源。

· Antibody Registry

与Antibody Resource 类似，Antibody Registry 也是以表格形式输出抗体试剂信息的数据库，输出供应商产品编号、完整抗体名称、结合状态、目标抗原和反应性、宿主物种、克隆性、合适的实验应用、参考 PMID 编号以及一级或二级抗体信息。但是，它是 RRID 计划的官方抗体识别数据库。

· CiteAb

CiteAb 是另一个综合抗体数据库，同样包含供应商信息（例如，产品编号、供应商名称、宿主物种、克隆性、纯化过程、反应性、同种型、浓度、储存、验证数据）和附加信息（例如缀合状态、目标蛋白）的和基因、修饰、一级或二级信息、参考文献和用户提交的验证数据。

· Antibodies Chemically Defined (ABCD)

ABCD 数据库于 2020 年推出，属于Expasy数据库的一部分，ABCD整合了具有已知序列（被验证过的）的抗体及其对应抗原的信息，每个抗体都有其ID 号，可在文献中查询，旨在帮助科研人员提高实验的可重复性。

· BenchSci

BenchSci 是一个AI 辅助抗体试剂选择平台，它收集相关的科学论文和试剂目录，使用专有的机器学习模型从中提取相关的数据点，使结果以易于使用的界面搜索方式提供，根据现有的实验证据，科学家们可以快速地预先确定一种特定的试剂是否适合他们的实验，该平台提供论文著作链接、供应商验证数据和其他独立研究的验证实验，BenchSci能够直接查找出文献中使用抗体的数据图，以及有关反应性、克隆性、宿主、PTM、特异性的数据，用户可以根据实验类型、组织、细胞系和疾病类型搜索抗体，输出的信息可以通过目标蛋白质、特定抗体名称或目录号进行过滤分类，还可保存搜索结果，及收到最近抗体动态信息通知。

· Linscott’s Directory of Immunological & Biological Reagents

该平台同样是一个包含供应商信息（例如，产品编号、供应商名称、宿主物种、克隆性、纯化过程、同种型、亚类、浓度、储存、目标蛋白和供应商网站）的数据储库。

· Validated Antibody Database

Validated Antibody Database可以输出供应商信息数据（例如，产品编号、供应商名称、宿主物种、克隆性、纯化过程、同种型、浓度、储存、运输条件、目标蛋白、应用程序和供应商网站），以及使用抗体的论文著作。

· EuroMAbNet

EuroMAbNet 与其他数据库的不同之处在于它对非商业抗体进行了编目，提供这些抗体在文献中的使用验证信息，例如宿主物种、克隆性、纯化过程、同种型、亚类、储存、浓度、目标蛋白、应用、交叉反应性和实验室网站。

· Bioz

Bioz是一个基于AI 的抗体数据库，提供供应商信息，例如，产品编号、供应商名称、宿主物种、克隆性、纯化过程、同种型、浓度、储存、结合状态、目标蛋白和参考。Bioz 对科研界人员免费，允许用户根据展示使用抗体的实验（例如 WB 、IHC 等）数据图进行搜索，此外Bioz根据抗体使用发表时间、发表著作影响因子等对抗体产品打分。

· Antybuddy

Antybuddy 是一个抗体评论数据库，其中列出了供应商信息（例如，产品编号、供应商名称、克隆性、实验应用、来自的供应商的验证），以及用户的评论和使用体验。

· pAbmAbs

pAbmAbs 同样是一个抗体评论平台，包含了供应商信息（例如，公司名称、目录号、宿主物种、目标蛋白、克隆性和应用），该网站还包含了用户使用抗体的实验方案、靶蛋白信息和稀释度，并且它也对提交数据的用户提供资金奖励，鼓励更多用户分享他们的验证信息。

抗体数据库的主要局限：缺乏抗体序列

以上数据库除了Antibodies Chemically Defined (ABCD)之外，均不包含抗体序列信息，而确认所使用抗体的氨基酸序列是确保实验可重复性的最理想的方法，这时就可以使用抗体从头测序（de novo antibody sequencing）来对抗体蛋白进行测序，从而方便确认抗体的性质，以及重组表达纯化，生成高度均一的抗体，提高实验的可重复性。快序生物拥有全球领先的抗体从头测序技术（de novo antibody sequencing），已成功对五千多例抗体蛋白进行测序，包括序列未知的抗体试剂，该技术可以对所有物种来源和类型的抗体进行直接测序，确定其氨基酸全长序列，无需杂交瘤细胞系或数据库信息，提供100% 覆盖率和准确度的服务保障。